רוני רייך מאוניברסיטת חיפה ואלי שוקרון מרשות העתיקות התחילו לעבוד בקרבת מעיין הגיחון ומאוחר יותר אף באזורים רבים נוספים. חפירה זו שינתה את הידוע על העיר ירושלים בתקופות העתיקות. בתחילה, הם מצאו שרידים של ביצור גדול מאד סביב המעיין שלצידו בריכה חצובה בסלע. בשלב הבא הם גילו כי הביצור הזה מתחבר למערכת שגילה צ' וורן כמאה ושלושים שנה קודם לכן ובכך יוצר מעבר תת- קרקעי המגיע אל ביצור מסיבי על גבי המעיין. בשלב הנוכחי (שעדיין בתהליך חפירה) זיהו ביצור שמחבר את המגדל שעל המעיין אל עבר מעלה הגבעה, ביצור זו עדיין נחקר ומהלכו לא ברור לגמרי.